扎赉特旗属中温带亚干旱气候区。四季分明,降水集中,雨热同季。无霜期较长,日照充足,积温有效性高,降水量偏少,蒸发量大。年平均气温为5.4℃。年平均降水量422.5mm,主要集中在6~8月,占年降水量的70%左右。本地降水量分布特点:降水自东南向西北递增。年平均风速2.8m/s,最多风向为西北西风,风向频率为13.5%。全年无霜期为152~190天。年平均日照为2807.5h。
历史极值:最大日降水量112.0mm,出现在1960年7月7日。极端最高气温41.3℃,出现在2017年5月18日;极端最低气温-38.9℃,出现在2001年2月4日。主要气象灾害:干旱、霜冻、冰雹、大风、洪涝、沙尘暴、寒潮等,其中干旱是影响农牧业最主要的气象灾害。